El cambio del bello color natural de uno de los más importantes ojos de agua de El Salvador de azul intenso a turquesa y luego a gris terracota, a detonado la alarma ambiental, ya que este fenómeno se ha vuelto ciclico y el olor fétido de la descomposición de las algas, aunado a la descomposición de los residuos depositados por los humanos, hace por imposible mantenerse cerca de la playa, además que su agua no es apta para consumo humano, además de que puede desarrollar alergias en los habitantes de la rivera.
Es por esto que el Ministerio de Medio de Medio Ambiente a través del Ministerio de Turismo deberán vigilar y montar todo un plan integral para frenar la contaminación, tarea que no será nada fácil, ya que es uno de los lugares turísticos más importantes del país, con una industria restaurantera en aumento. Sin embargo no existe una adecuada disposición de los deshechos, producto de esta actividad que ha llevado a esta emergencia ambiental.
Por ello el Ministerio de Medio Ambiente ha decretado Estado de Emergencia del Lago de Coatepeque, en donde todas las instituciones del estado que tienen incidencia en la preservación del medio ambiente tendrán sus obligaciones.
«Es por ello que será el Ministerio de Turismo, deberá velar por las actividades turísticas en la zona y ha decretado estado de emergencia ambiental por un año en el lago de Coatepeque ante la contaminación actual que presenta, debido a la proliferación de cianobacterias»-
Al Ministerio de Gobernación le pide adoptar medidas a través de Protección Civil, mientras que al Ministerio de Salud le solicita que se encargue de hacer análisis de toxicidad y posibles efectos en la salud humana y así cada una de las instituciones.